Справки по форме 2-НДФЛ, которые представляются в налоговый орган в электронном виде, проходят форматно-логический контроль, в частности, такому контролю подвергается поле "Номер корректировки".

Согласно Порядку заполнения справки 2-НДФЛ (утв. приказом ФНС России от 30.10.2015 № ММВ-7-11/485@) при составлении корректирующей справки в указанном поле проставляется "01", "02" и так далее, а при составлении аннулирующей справки – "99".

С выходом этого приказа если после аннулирующей справки налоговый агент представлял корректирующие, то при прохождении форматно-логического контроля возникали проблемы, поскольку программным обеспечением налоговых органов не было предусмотрено представление таких справок.

ФНС России выпустила письмо от 10.06.2016 № БС-4-11/10398, в котором разъяснила, что в настоящее время программное обеспечение по приему сведений о доходах физических лиц доработано: с 27.04.2016 после представления аннулирующей справки (с номером корректировки 99) можно представлять корректирующие справки с номером корректировки 01.

Данные разъяснения поддерживаются в учетных решениях "1С:Предприятия 8".