Напомним, что освобождение от обложения НДС услуг по перевозке пассажиров железнодорожным транспортом пригородного сообщения приостановлено с 1 января 2015 года. Вместо этого перевозчики применяют нулевую ставку НДС (пп. 9.2 п. 1 ст. 164 НК РФ).

Такое положение было внесено в НК РФ, чтобы снизить для населения стоимость проезда в пригородных поездах, ведь при использовании освобождения от НДС перевозчики включали в эту стоимость тот НДС, который предъявляли им поставщики и подрядчики (арендодатели подвижного состава, исполнители ремонтных работ и др.). При нулевой ставке налога у перевозчиков есть возможность принять такой НДС к вычету и не увеличивать за счет этого стоимость проезда.

Планировалось, что описанный порядок налогообложения сохранится до окончания 2016 года (п. 3 – 5 ст. 3 Федерального закона от 06.04.2015 № 83-ФЗ в прежней редакции). Однако Федеральным законом от 02.06.2016 № 173-ФЗ действие перечисленных норм продлено до конца 2017 года.

Отметим, что нулевая ставка действует независимо от того, по каким тарифам осуществляется перевозка – льготным (установленным органами местного самоуправления) или коммерческим. Это пояснили специалисты Минфина России в письме от 29.05.2015 № 03-07-11/31211.

Подробнее о налогообложении НДС услуг транспортной перевозки см. справочник "Налог на добавленную стоимость".