В письме от 18.03.2016 № СД-3-3/1141@ ФНС России рассмотрела следующую ситуацию. Подрядчик выполнил работы, стоимость которых превысила стоимость работ, предусмотренных договором. Заказчик отказался оплачивать сумму превышения, поэтому подрядчик подал на него в суд и выиграл его.

Суд признал неоплаченную сумму суммой необоснованного обогащения заказчика и обязал выплатить ее подрядчику с учетом НДС. Должен ли подрядчик при получении указанной суммы выставить заказчику счет-фактуру?

Налоговое ведомство разъяснило следующее. Если полученные подрядчиком от заказчика суммы необоснованного обогащения фактически являются оплатой стоимости работ, выполненных подрядчиком, то такие суммы включаются в налоговую базу по НДС на основании пп. 2 п. 1 ст. 162 НК РФ. При получении этих сумм подрядчик должен составить счет-фактуру в одном экземпляре и зарегистрировать его в книге продаж в установленном порядке. Счет-фактура заказчику в этом случае не выставляется.

Подробнее о суммах, увеличивающих налоговую базу по НДС, см. в справочнике "Налог на добавленную стоимость".