Если ИП не заявил о прекращении облагаемой ПСН деятельности и не оплатил оставшуюся часть стоимости патента, то с полученного дохода необходимо уплатить только НДФЛ.
Индивидуальный предприниматель (ИП), применяющий патентную систему налогообложения (ПСН), может прекратить облагаемую ПСН деятельность до истечения срока действия патента. При этом ИП обязан заявить о данном факте в налоговую инспекцию в течение 10 календарных дней с момента прекращения указанной деятельности (п. 8 ст. 346.45 НК РФ). В таком случае налоговым периодом в отношении ПСН признается период с начала действия патента до даты прекращения такой деятельности. Дата указывается предпринимателем в соответствующем заявлении (п. 3 ст. 346.49 НК РФ). Если ИП не подавал заявление о прекращении деятельности до истечения действия патента, то налоговым периодом будет по-прежнему признаваться период, на который был получен патент. Неоплаченная к этому моменту часть стоимости патента должна быть оплачена в срок, установленный п. 2 ст. 346.51 НК РФ, независимо от того, что предпринимательская деятельность была прекращена до окончания действия патента. В противном случае предприниматель будет считаться утратившим право на применение ПСН и перешедшим на общий режим налогообложения с начала налогового периода, на который ему был выдан патент (пп. 3 п. 6 ст. 346.45 НК РФ). Такой вывод содержится в письме Минфина России от 10.10.2014 № 03-11-12/51037.
Подробнее об утрате права на ПСН см. в справочнике "Патентная система налогообложения".