Такой вывод содержится в постановлении ФАС Северо-Западного округа от 24.07.2014 № А05-9711/2013.

Суд подчеркнул, что вычетам подлежат суммы НДС, предъявленные покупателю и уплаченные им при приобретении услуг на территории РФ для осуществления операций, признаваемых объектами налогообложения согласно гл. 21 НК РФ (п. 2 ст. 171 НК РФ). При этом положения НК РФ исключают возможность заявления к вычету сумм НДС, уплаченных налогоплательщиком с нарушением требований гл. 21 НК РФ.

Таким образом, из-за ошибки продавца в ставке НДС (даже если он ошибся ненамеренно), у покупателя непременно возникнут проблемы с вычетом налога. Ведь счета-фактуры с неверной ставкой не соответствуют обязательным требованиям ст. 169 НК РФ и не могут служить основанием для вычета НДС. Учитывая разъяснения Минфина России по этому вопросу, а также устоявшуюся арбитражную практику, оспорить отказ в вычете в подобной ситуации не представляется возможным.

Подробнее см. справочник "Налог на добавленную стоимость".