На это в письме от 10.06.2014 № 03-04-06/28072 указал Минфин России. Ведомство рассмотрело ситуацию, когда у иностранной организации на территории России есть два обособленных подразделения, одно из которых не выделено на отдельный баланс и не имеет собственного банковского счета. Поэтому его сотрудникам заработная плата выплачивается через расчетный счет другого подразделения данной организации.

Поясняя порядок удержания и перечисления НДФЛ в описанной ситуации, Минфин России напомнил, что согласно п. 1 ст. 226 НК РФ обособленные подразделения иностранных организаций в России являются налоговыми агентами по НДФЛ. Следовательно, они должны исчислить, удержать и уплатить в бюджет сумму налога при фактической выплате дохода физическим лицам (п. 4 ст. 226 НК РФ). Никаких исключений для выполнения этого требования в отношении обособленных подразделений, не выделенных на отдельный баланс и не имеющих расчетного счета, НК РФ не предусмотрено. Таким образом, если такое обособленное подразделение не может исполнить обязанности налогового агента по НДФЛ, ему необходимо в порядке, установленном п. 5 ст. 226 НК РФ, сообщить в инспекцию по месту учета и самому налогоплательщику о невозможности удержать НДФЛ и сумме налога. Сделать это нужно в течение месяца после окончания года, в котором был выплачен доход. Только после этого обязанность по уплате НДФЛ будет возложена непосредственно на физическое лицо (пп. 4 п. 1, п. 2 ст. 228 НК РФ).

Подробнее об исполнении обязанностей налогового агента по НДФЛ см. справочник "Налог на доходы физических лиц".