В большинстве случаев плательщики УСН не признаются плательщиками НДС (п. 2, 3 ст. 346.11 НК РФ). В подобной ситуации они не обязаны предъявлять покупателям сверх стоимости реализуемых товаров (работ, услуг) сумм НДС и выставлять счета-фактуры, поскольку это должны делать только плательщики НДС (ст. 168, 169 НК РФ). Если счет-фактура с указанием суммы НДС не выставлялся, однако соответствующая сумма НДС была выделена в договоре или платежно-расчетных документах, то уплативший ее покупатель в составе стоимости товаров (работ, услуг) вправе впоследствии потребовать у продавца ее возврата в качестве неосновательного обогащения. Это связано с тем, что лицо, которое безосновательно приобрело или сберегло имущество за счет другого лица, обязано возвратить последнему указанное имущество, которое признается неосновательным обогащением приобретателя (п. 1 ст. 1102 ГК РФ). По мнению судов, к неосновательному обогащению относится и сумма НДС, предъявленная продавцом, который не является плательщиком этого налога, и уплаченная покупателем.

Если был выставлен счет-фактура с выделением в нем суммы НДС, то плательщик УСН обязан заплатить эту сумму в бюджет (п. 5 ст. 173 НК РФ). В такой ситуации неосновательного обогащения у продавца, применяющего УСН, не возникает.

(см. определения ВАС РФ от 20.12.2013 № ВАС-18001/13, от 08.04.2008 № 4156/08, постановления Арбитражного суда Поволжского округа от 14.08.2014 № А65-19815/201, ФАС Московского округа от 02.11.2011 № А40-131937/10-59-1153).

Подробнее о том, какие налоги не надо уплачивать при применении УСН, см. в справочнике "Упрощенная система налогообложения".