Продавец, который не является плательщиком НДС, не обязан выставлять своим покупателям счета-фактуры с выделенной суммой налога (ст.ст. 168, 169 НК РФ). Однако если по тем или иным причинам такой продавец выставит покупателю счет-фактуру с выделением суммы НДС, он обязан будет уплатить эту сумму в бюджет (пп. 1 п. 5 ст. 173 НК РФ). При этом возникает вопрос, может ли покупатель принять НДС, предъявленный ему в таком счете-фактуре, к вычету. ФАС Московского округа в постановлении от 23.06.2014 № Ф05-5802/2014 пришел к выводу о правомерности вычета "входного" НДС в данной ситуации. По мнению суда, ст.ст. 171, 172 НК РФ не содержат таких условий для принятия к вычету НДС, как приобретение товара у лица, являющегося плательщиком НДС, и уплата этим лицом НДС, полученного от реализации товара, в бюджет. Кроме того, факт нарушения продавцом своих налоговых обязанностей сам по себе не является доказательством получения покупателем необоснованной налоговой выгоды (п. 10 Постановления Пленума ВАС РФ от 12.10.2006 № 53). Неуплата контрагентом налогов является основанием для применения к нему мер принудительного взыскания налогов, а не для отказа налогоплательщику в применении налоговых вычетов (при соблюдении прочих условий для вычета).

Подробнее о том, правомерен ли вычет по счету-фактуре, выставленному неплательщиком НДС или лицом, осуществляющим необлагаемые операции, см. справочник "Налог на добавленную стоимость".