Согласно п. 2 ст. 230 НК РФ (в редакции, действующей с 1 января 2016 года) налоговые агенты – российские организации с обособленными подразделениями – представляют справки по форме 2-НДФЛ в отношении работников этих подразделений в налоговый орган по месту учета таких обособленных подразделений. Также в налоговый орган по месту учета обособленных подразделений представляются справки по форме 2-НДФЛ в отношении физлиц, получивших доходы по договорам гражданско-правового характера, которые заключены с данными подразделениями.

В письме oт 30.12.2015 № БС-4-11/23300@ ФНС России разъяснила, что в указанном порядке представляются справки по форме 2-НДФЛ за 2015 год.

Таким образом, при выплате в 2015 году доходов физлицам, которые выполняли работы по гражданско-правовым договорам в обособленных подразделениях, справки по форме 2-НДФЛ в отношении этих лиц следует представлять в налоговый орган по месту нахождения подразделений.

Отметим, что ранее порядок уплаты налога и представления формы 2-НДФЛ в отношении физлиц, выполнявших работы в обособленном подразделении по договорам ГПХ, в Налоговом кодексе прописан не был. Вместе с тем контролирующие органы и прежде считали, что уплачивать НДФЛ в отношении таких физлиц и, соответственно, представлять сведения о них необходимо по месту нахождения обособленных подразделений (письма Минфина России от 22.11.2012 № 03-04-06/3-327, от 06.08.2012 № 03-04-06/3-2126 и др.).

Подробнее об удержании НДФЛ с оплаты по гражданско-правовому характеру см. в справочнике "Налог на доходы физических лиц".