В письме Минфина России от 08.04.2014 № 03-07-15/15870 (разослано по нижестоящим налоговым органам письмом ФНС России от 21.04.2014 № ГД-4-3/7606) рассмотрена следующая ситуация. Налогоплательщик ввез товары, заплатил НДС, скорректированный таможенным органом. Однако в дальнейшем суд признал такую корректировку неправомерной и обязал таможенный орган вернуть излишне взысканный НДС.

Если налогоплательщик уже заявил к вычету данную сумму налога, то он должен восстановить его в периоде вступления в силу упомянутого решения суда. Ранее Минфин настаивал на восстановлении НДС за период, в котором он был заявлен к вычету. Подробнее см. статью-рекомендацию: Можно ли принять к вычету "ввозной" НДС, если он ошибочно взыскан таможенным органом?