Напомним, что предприниматель, получивший патент на срок более 6 месяцев, должен уплатить налог двумя частями: 1/3 – не позднее 25 календарных дней с начала действия патента, 2/3 – не позднее тридцати календарных дней до окончания налогового периода (п. 2 ст. 346.51 НК РФ). Если стоимость патента не будет уплачена в установленные сроки, право применять ПСН утрачивается. В подобной ситуации предприниматель считается перешедшим на общий режим налогообложения с начала налогового периода, на который ему был выдан патент: так, он должен будет перечислять НДФЛ и НДС. Причем, как указано в п. 7 ст. 346.45 НК РФ, в этом случае не придется уплачивать пени за несвоевременное перечисление авансовых платежей. В то же время налоговым периодом по НДС является квартал, а налог уплачивается не авансовыми платежами, а по итогам каждого налогового периода равными долями не позднее 20-го числа каждого из трех месяцев, следующего за истекшим кварталом (пп. 1 п. 1 ст. 146, ст. 163 НК РФ, п. 1 ст. 174 НК РФ). В связи с этим Минфин России в письме от 21.03.2014 № 03-11-11/12308 разъясняет, что главой 26.5 НК РФ не установлено освобождение от уплаты пеней за несвоевременное перечисление налога, по которому перечисление авансовых платежей не предусмотрено. Следовательно, предприниматель, утративший право на ПСН ввиду неперечисления налога в установленный срок, должен будет уплатить пени по НДС.

Подробнее об утрате права на ПСН см. Справочник "Патентная система налогообложения".