Для возмещения НДС в заявительном порядке в инспекцию необходимо представить в частности банковскую гарантию. Она свидетельствует о том, что банк обязуется по требованию налогового органа уплатить НДС за налогоплательщика, если по результатам проверки ранее вынесенное решение о возмещении налога будет полностью либо частично отменено (пп. 2 п. 2 ст. 176.1 НК РФ). Дело в том, что в случае принятия подобного решения налогоплательщик должен перечислить в бюджет излишне возвращенный (зачтенный) НДС (п. 15 ст. 176.1 НК РФ). Причем произвести такую уплату потребуется с процентами, рассчитанными исходя из двукратной ставки рефинансирования ЦБ РФ (п. 17 ст. 176.1 НК РФ). По вопросу налогоплательщика о том, нужно ли, чтобы банковская гарантия была выдана в том числе и на сумму этих процентов, ФНС России дала разъяснения в письме от 05.02.2014 № ГД-4-3/1884@. По мнению налогового ведомства, достаточно, чтобы банковская гарантия покрывала в полном объеме заявленную к возмещению сумму НДС. Обеспечивать, помимо этого, возврат банком процентов она не должна.

Подробнее о заявительном порядке возмещения налога см. Справочник "Налог на добавленную стоимость".