В письме от 26.02.2015 № 03-07-11/9545 Минфин России разъяснил вопрос, касающийся применения раздельного учета "входного" НДС.

Согласно абз. 4 п. 4 ст. 170 НК РФ налогоплательщик обязан вести раздельный учет сумм НДС по приобретенным товарам (работам, услугам, имущественным правам), если они одновременно используются в операциях, которые облагаются и не облагаются налогом. Это необходимо, чтобы определить, какую часть суммы НДС принять к вычету, а какую учесть в стоимости приобретенных товаров (работ, услуг, имущественных прав).

В противном случае суммы налога по таким приобретениям вычету не подлежат и в расходы по налогу на прибыль (в составе стоимости приобретения) не включаются (абз. 6 п. 4 ст. 170 НК РФ).

Однако НК РФ предоставляет налогоплательщику возможность не вести раздельный учет сумм "входного" НДС и полностью принять его к вычету. Сделать это можно только при условии, если в налоговом периоде доля совокупных расходов на приобретение, производство и (или) реализацию товаров (работ, услуг, имущественных прав), операции по реализации которых не подлежат налогообложению, не превысит 5 процентов от совокупной суммы расходов ("правило 5 процентов") (абз. 7 п. 4 ст. 170 НК РФ).

Проанализировав данные нормы, Минфин России отметил, что "правило 5 процентов" применяется только в отношении расходов налогоплательщика. При этом положения НК РФ не отменяют обязанности плательщика НДС вести раздельный учет, если доля доходов от реализации облагаемых НДС товаров (работ, услуг, имущественных прав) будет менее 5 процентов.

Таким образом, налогоплательщик, получивший от операций, облагаемых НДС, доход менее 5 процентов от общей суммы доходов за налоговый период, вести раздельный учет все-таки обязан.

Подробнее о раздельном учете "входного" НДС см. справочник "Налог на добавленную стоимость".