Решение инспекции об отказе в возмещении НДС можно сразу обжаловать в суд.
В постановлении от 24.01.2014 № А56-10790/2013 ФАС Северо-Западного округа рассмотрел вопрос, обязательно ли обжаловать отказ в возмещении НДС в вышестоящий налоговый орган, прежде чем обращаться в суд. В рассматриваемой ситуации налоговая инспекция отказала организации в возмещении НДС и при этом привлекла ее к ответственности в виде штрафа (п. 1 ст. 122 НК РФ). В свою очередь налогоплательщик, посчитав решение об отказе в возмещении налога незаконным, сразу же обратился с заявлением в суд. Рассматривая спор, арбитры пришли к выводу, что в НК РФ нет положений, обязывающих урегулировать споры о возмещении налогов в досудебном порядке. Следовательно, такие имущественные требования можно предъявить в суд независимо от оспаривания ненормативных правовых актов инспекции. Таким образом, организация правомерно не обжаловала решение об отказе в возмещении НДС в досудебном порядке, а сразу обратилась в суд с требованием имущественного характера.
Подробнее о том, почему налоговые органы настаивают, что досудебный порядок обжалования распространяется на решения об отказе в возмещении налога, см. Справочник "Налог на добавленную стоимость".