Доход сотрудника-нерезидента от трудовой деятельности за пределами РФ не облагается НДФЛ (пп. 6 п. 3 ст. 208, ст. 209 НК РФ). Это относится к случаям, когда иностранец работает в филиале российской организации за пределами РФ. Однако как и любому другому сотруднику, нерезиденту, работающему в зарубежном филиале, головная организация может перечислить материальную помощь. Такая выплата не связана с выполнением трудовых обязанностей и признается доходом физлица-нерезидента от источника в Российской Федерации (п. 2 ст. 209 НК РФ). Это означает, что она облагается НДФЛ по ставке 30 процентов (п. 3 ст. 224 НК РФ). При этом организация, выплачивающая матпомощь сотруднику-нерезиденту из своего зарубежного филиала, должна удержать с этих сумм НДФЛ при их фактической выплате (п. 4 ст. 226 НК РФ). Такие выводы сделаны в постановлении ФАС Северо-Западного округа от 16.01.2014 № А13-2639/2013.

Подробнее о том, какие доходы облагаются и не облагаются НДФЛ см. в Справочнике "Налог на доходы физических лиц".