Условиями принятия НДС к вычету являются принятие товаров (работ, услуг) к учету, использование их в облагаемой НДС деятельности, а также наличие счета-фактуры (ст.ст. 171, 172 НК РФ).
На практике возможна ситуация, когда товары (работы, услуги) принимаются к учету в одном периоде, а счет-фактура поступает в более позднем периоде.
Вычет в таком случае можно заявить в периоде принятия товаров (работ, услуг, имущественных прав) на учет, если счет-фактура получен до истечения срока подачи налоговой декларации за этот период (абз. 2 п. 1.1 ст. 172 НК РФ).
Если счет-фактура получен позже, то у покупателя возникает вопрос, в каком периоде регистрировать счет-фактуру, полученный с опозданием, и заявлять по нему вычет НДС: в периоде получения или в периоде выставления счета-фактуры (т. е. уточнять налоговые обязательства прошедшего периода). Положения НК РФ не отвечают на данный вопрос.
Рекомендации
Если счет-фактура получен после того как истек срок подачи декларации, то вычет следует заявлять в периоде его получения. Так поступать советуют контролирующие органы.
Обоснование следующее.
Согласно положениям ст. 172 НК РФ вычет НДС возможен только при наличии счета-фактуры. В рассматриваемой ситуации условия применения вычета будут соблюдены покупателем только в периоде получения счета-фактуры, даже если он составлен продавцом раньше.
(См. письма Минфина России от 08.08.2014 № 03-07-09/39449, от 02.10.2013 № 03-07-09/40889, от 09.07.2013 № 03-07-11/26592, от 03.05.2012 № 03-07-11/132, ФНС России от 28.07.2014 № ЕД-4-2/14546).
Аналогичный порядок действует при обмене электронными документами. Вычет по электронному счету-фактуре нужно заявлять в периоде его получения (см. письма Минфина России от 17.08.2020 № 03-03-06/1/72012, от 14.02.2019 № 03-07-11/9305, от 08.02.2019 № 03-07-11/7566).
Обратите внимание, получение бумажного счета-фактуры с опозданием должно быть подтверждено (например, соответствующей записью в журнале корреспонденции или почтовыми документами). Порядок подтверждения даты получения счета-фактуры налогоплательщик должен определить самостоятельно, отразив его в учетной политике для целей налогообложения. В противном случае контролеры откажут в вычете по "опоздавшему" счету-фактуре в периоде его фактического получения. Поэтому если налогоплательщик не может подтвердить получение счета-фактуры в более позднем периоде, чем выставлен, во избежание споров с контролерами вычет следует заявить в периоде совершения хозоперации (составления счета-фактуры). Для этого счет-фактуру следует зарегистрировать в дополнительном листе книги покупок (письмо ФНС России от 06.09.2006 № ММ-6-03/896@) и представить уточненную декларацию за период выставления счета-фактуры.