Работодатели обязаны вести воинский учет военнообязанных и подлежащих призыву сотрудников. Вести воинский учет должны только работодатели-организации. Индивидуальные предприниматели, у которых есть сотрудники, вести их воинский учет не обязаны.
О том, какие настройки для ведении воинского учета необходимо сделать в программе "1С:Зарплата и управление персоналом 8" (ред. 3), читайте в новой статье справочника "Кадровый учет и расчеты с персоналом в программах 1С":