По ТК РФ оплата отпуска производится не позднее чем за 3 дня до его начала. Если сотрудник уходит в отпуск с первого числа месяца, то на момент расчета отпускных последний месяц расчетного периода не отработан им полностью. Поэтому после начисления зарплаты за соответствующий месяц необходимо сделать перерасчет отпускных с учетом отработанного месяца.
О том, как в программе "1С:Зарплата и управление персоналом 8" (ред. 3) рассчитать такой отпуск, читайте в актуализированной статье справочника "Кадровый учет и расчеты с персоналом в программах 1С":