Чтобы создать новый проект мобильного приложения выполните следующие действия:
Установка одного или другого флажка «настраивает» 1C:EDT на разработку конкретного вида приложения. Например, если флажок Приложение для мобильной платформы установлен, а Приложение для платформы снят, то в проекте будут недоступны типы объектов, которые нельзя использовать в мобильной версии «1С:Предприятия».
Подробнее о свойствах конфигурации, связанных с разработкой мобильных приложений, можно прочитать в документации «1С:Предприятия».