Для целей конвертации хранилища и синхронизации его с репозиторием мы рекомендуем использовать сервер хранилища конфигурации. По нашему опыту в данной ситуации он работает намного быстрее простого файлового хранилища.
Убедитесь, что версия 1С:Предприятия, используемая для работы с хранилищем, поддерживается той версией 1C:EDT (1.8.1 и выше), которую вы будете устанавливать на сервер 1С:ГитКонвертера. Если это не так, конвертируйте хранилище конфигурации на нужную версию платформы.
Если вы решили использовать копии хранилища, настройте размер глобального кэша так, как это описано в разделе Копии хранилища.