Ответ:
В программе "1С:Бухгалтерия 8" (ред. 3.0) начисленные пени (штрафы) отражаются вручную документом "Операция":
- Меню: Операции – Операции, введенные вручную (рис. 1).
- Кнопка "Создать", выбрать "Операция".
- В поле "От" укажите дату начисления пеней. Если пени начислены по результатам проверки, укажите дату вступления в силу
решения налогового органа. Если пени начислены организацией самостоятельно, укажите дату их расчета.
- В поле "Дебет" выберите субсчет 99.01.1 "Прибыли и убытки
по деятельности с основной системой налогообложения" и субконто к нему "Причитающиеся налоговые санкции".
- В поле "Кредит" выберите субсчет расчетов по налогу, по
которому начисляются пени (например, субсчет 68.02 "Налог на добавленную стоимость") и субконто
к нему "Пени: доначислено/уплачено (самостоятельно)".
- Кнопка "Записать и закрыть".

Рис. 1