Ответ:

В программе "1С:Бухгалтерия 8" (ред. 3.0) начисленные пени (штрафы) за нарушение договорных или долговых обязательств отражаются вручную документом "Операция" (рис. 1):

1. Раздел: Операции – Операции, введенные вручную.
2. Кнопка "Создать", выбрать "Операция".
3. В поле "От" укажите дату начисления пеней (штрафа).
4. В поле "Дебет" выберите счет 91.02. "Прочие расходы" и субконто к нему "Штрафы, пени, неустойки к получению (уплате)":
   • в бухгалтерском учете штрафы, пени, неустойки за нарушение условий договоров включаются в состав прочих расходов (п. 12 ПБУ 10/99);
   • в налоговом учете штрафы, пени и иные санкции за нарушение договорных или долговых обязательств включаются в состав внереализационных расходов (пп. 13 п. 1 ст. 265 НК РФ).
5. В поле "Кредит" выберите счет 76.09 "Расчеты по претензиям" и субконто к нему из справочников "Контрагенты" и "Договоры".
6. Укажите сумму штрафа (пеней).
7. Кнопка "Записать и закрыть".

Рис. 1